棉籽与其他油籽（如葵花子）有类似的结构，由硬壳包覆著含油内核（种子）。棉籽油使用在沙拉油、沙拉酱、美乃滋、或洋芋片等零食，因为它味道安定，不会掩盖原味，遇热不易起油烟。

棉籽油一般含70％的不饱和脂肪酸（18％的单元不饱和，52％的多元不饱和）、26％的饱和脂肪酸[4]。完全氢化时则是94％的饱和脂肪酸和2％的不饱和脂肪酸（1.5％的单元不饱和，0.5％的多元不饱和。

棉花及锦葵科植物（如秋葵）会产生出一种具有毒性的黄色多酚类化合物——棉酚[5]，但也有研究指出，棉花以外的锦葵科植物不会产生棉酚。这种天然的有色化合物能够从棉花植物的种、叶、茎、根、以及主根树皮内的微小腺体中发现，尤其种子含量最多]。棉籽约含0.5-0.7％棉酚[8]。化合物的适应功能有利于抵御虫害或病菌侵袭。

为了在碱炼工艺中将毛棉籽油中的棉酚脱除干净,避免因棉酚的存在而导致对棉籽高烹油、色拉油的不良影响,同时减少中性油的损耗,采用低温长混碱炼工艺,即碱炼温度40～50℃,碱炼时间60 min.生产实践表明,采用低温长混碱炼工艺不仅中性油炼耗低,精炼得率高,而且在碱炼工段可将棉籽油的色泽降低到Y35R2.5(25.4 mm 槽),为生产高品质的高烹油、色拉油提供原料油.

我公司提出的低温长混碱炼工艺保证了碱和游离脂肪酸或棉酚的皂化反应几乎是瞬间完成的，但为了尽可能的脱除棉籽油中的棉酚，需要增加反应时间。通过六十到九十分钟的反应，生成的皂有充分的时间吸附棉酚，从脱色、脱臭中能比较容易的生产出色泽较好的棉籽油。在传统的碱炼工艺中仅需要增加反应罐的容量就可以进行低温长混碱炼工艺的操作，对现有工艺和设备的改造费用较低。低温长混碱炼工艺因为在温度较低 增加氢氧化钠溶液，可以减少中性油皂化的概率，故炼耗较低，精炼收率较高。通过低温长混碱炼工艺生产的棉清油质量较好，色泽浅，为生产高品质的棉籽高烹油、色拉油提供较好的原料油。
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