转基因油脂是以转基因油料为原料生产的油脂。转基因食品安全在国际上众说纷纭，其对人体健康是否有影响，科学上还没有定论。由于我国并不限制使用“转基因”原料，生产厂家选择“转基因”原料生产主要还是出于成本考虑。目前，我国市售的转基因油脂主要是大豆油。
　　
       目前很多国家对转基因食物的态度都非常谨慎。如欧盟等一些国家尽管允许某些转基因成分在食物中使用，但当欧盟的法律收紧后，实质上禁止了任何新的转基因食物。挪威是全世界监管转基因食物最严格的国家，政府禁止数种含有转基因作物及制品进口，政府亦执行转基因标签制度。日本自２００１年４月１日所有的转基因食物都规定必须经过安全检验，执行强制性标签制度。我国食油的国家标准中规定，转基因油脂须在标签中标识。

"食用油脂中是几乎不含转基因成分的",中国粮油学会油脂分会会长王瑞元在参加行业学术讨论会时，讲述了食用油与转基因之间的微妙关系："转基因主要是存在于蛋白质中，各类油料无论是通过压榨还是浸出工艺制油，蛋白最后是分离到油料饼粕中，食用油脂通过精炼处理后基本不含有蛋白，油脂中是检测不出转基因成分的。" 

　　西安油脂科学研究院的科技工作者在国内率先完成了“转基因大豆油的安全性研究——动物实验”。经对比分析认为，转基因油料、油脂在特征指标和脂肪酸组成上与非转基因油料、油脂无明显的差别。动物急性、长期毒性实验结果表明转基因大豆油和棉籽油未发现毒性。